Con el regreso de la bicameralidad, las comisiones se dividen entre la Cámara de Diputados y el Senado. Estos grupos especializados constituyen uno de los primeros filtros de los proyectos de ley antes de que sean debatidos en el Pleno.

Los principales cambios están en la Comisión de Fiscalización que será presidida por Perú Libre, en la Comisión de Constitución, que será presidida por Fuerza Popular, y en la Comisión de Trabajo que será del Bloque Magisterial.